Всё это было безуспешно, хотя в борьбе с Пироговым канцелярские чиновники имели поддержку некоторых профессоров, отсталых в научном отношении, равнодушных к поста­новке преподавания и подготовке врачей, но весьма ревностных в получении доходов от медицинской практики. А доходам этих про­фессоров — хирургов и не хирургов — угрожал большой ущерб.

Николай Иванович приехал в Петербург с репутацией чудесного доктора. Его врачебная практика увеличивалась со дня на день. К нему приходили больные с самыми разнооб­разными недугами. В числе его пациентов были люди всех классов и всех слоев населе­ния—от полунищих крестьян из пригородов до членов царской семьи. Полнейшая доступ­ность знаменитого профессора, простота его, редкое бескорыстие, доброта и ласковость в обращении с детьми привлекли к нему общую любовь и создали огромную извест­ность.

Свою врачебную практику Пирогов рассмат­ривал не как источник дохода, а как помощь страждущим и материал для изучения проис­хождения болезней, для борьбы с ними.

В труде Пирогов был неутомим. Кроме многочисленных и сложных обязанностей по Медико-хирургической академии. Николай Иванович взял на себя в Петербурге много других работ. Он был директором инструмен­тального завода военно-медицинского ведом­ства — руководил научной стороной изготов­ления и усовершенствования инструментов для всех хирургических учреждений страны. Был бесплатным консультантом во всех крупных больницах и лечебницах столицы. Деятельно работал в учебных медицинских советах и комиссиях военного и гражданского ведомств. Составлял программы преподавания по меди­цине для университетов и других учебных за­ведений, правила для экзаменов врачей и сту­дентов и т. п. Часто исполнял поручения воен­ного ведомства по инспектированию госпита­лей в различных концах страны — от Финлян­дии до Кавказа.

Пирогов был одним из глазных и самых видных деятелей научной и практической ме­дицинской жизни тогдашней России. Попу­лярности Николая Ивановича содействовали его многочисленные слушатели, восхищав­шиеся разнообразными талантами своего про­фессора. На лекции Пирогова приходили не только студенты тех курсов академии, кото­рым полагалось сдавать экзамены по его предметам, но слушатели всех других отделе­ний. В Медико-хирургической академии в часы лекций Николая Ивановича пустовали ауди­тории других профессоров. По их жалобам на­чальство предписало студентам посещать лек­ции Пирогова и практические занятия у него только в часы, свободные от других лекций. Научная деятельность Пирогова в петер­бургский период его профессуры была так же значительна, как и в Юрьеве. За это время Николай Иванович сделал 69 научных сооб­щений в столичном обществе практических врачей. Кроме этого общества, Николай Ива­нович делал научные доклады в Пироговском кружке. Это было частное собрание несколь­ких наиболее видных по положению и науч­ным заслугам петербургских врачей, объеди­нившихся вокруг молодого профессора Ме­дико-хирургической академии и назвавших свой кружок его именем. Согласно протоколь­ным записям кружка, он имел за шесть лет сто заседаний. Николай Иванович не был только на последних шести заседаниях за отъ­ездом в 1854 году в Крым. Он сделал в кружке 141 доклад на самые различные темы из всех отделов медицины. Другие участники кружка не были так продуктивны: самый работоспособный из них сделал в кружке 82 доклада.

В академической клинике Пирогова, по дан­ным историка его кафедры, было произведено за 1843—1854 годы 1140 хирургических опера­ций, в среднем по 104 операции в год, с под­робными научными описаниями их. Кроме того, лично Пироговым или под его руковод­ством произведено много тысяч операций в Обуховской и других столичных больницах,

где он был консультантом. Сам Николай Ива­нович произвёл за эго время около 12 тысяч вскрытий трупов с подробным описанием каждого.

За время своей петербургской научно-иссле­довательской и преподавательской деятельно­сти Пирогов напечатал несколько капитальных трудов и много небольших по объёму, весьма содержательных монографий и журнальных статей.

Из основных трудов Николая Ивановича в период его петербургской профессуры первым стал печататься «Полный курс прикладной анатомии человеческого тела с рисунками. Анатомия описательно физиологическая и хи­рургическая». Курс не был закончен печата­нием вследствие банкротства издателя. Не до­шла до нас и рукопись Пирогова.